L'agence fonctionne grâce à 2 instances décisionnelles :
L'agence mobilise une équipe restreinte en charge de l'administration générale et des missions support de l'établissement public (Secrétariat et animation des instances décisionnelles, pilotage de l'activité, gestion financière et budgétaire, suivi administratif, développement de l'activité auprès des équipes et des adhérents).
La prise en charge des missions au profit des adhérents se fait quasi exclusivement par l’intermédiaire d'une convention de mise à disposition des services du Conseil départemental des Alpes de Haute-Provence (aussi dénommé le "Département").